Un tiempo después de los acontecimientos de la primera película, el joven Miles Morales sigue sus actividades heroicas como el nuevo Spider Man y ahora emprende una aventura a través del multiverso, junto a su amiga de otro universo Gwen Stacy, el misterioso Miguel O'Hara, un Spider Man proveniente del año 2099 en el futuro y un nuevo equipo de Spider-People para enfrentarse a un poderoso villano.